воскресенье, 18 декабря 2011 г.

Модели сканеров Aperio



Компания "Aperio" - признанный лидер на рынке микроскопических слайд-сканеров. На сегодняшний день в мире стоят уже более 800 сканеров от Aperio. В России продукция от Aperio продается компанией Biovitrum. Эта статья - краткое введение в линейку Aperio, рассказывающая об основных различиях между моделями.


Scanscope OS
Одностекольная загрузка. Достаточно долгое время сканирования стекла (20 минут, и эта цифра не для всего стекла, а лишь для квадрата 10х10 мм.), но и наилучшее разрешение получаемого снимка (0.14 мкм на пиксель изображения) - работа идет на объективе 60х/1.35, результирующее увеличение - 100х.


Scanscope GL
Одностекольная загрузка. Рассчитаны на небольшую нагрузку лаборатории - 40-50 стекол в день. Время сканирования стекла размерами 26,3х54 мм составит 2 минуты. Рабочий объектив - 20х. Разрешение - 0.25 мкн. на 1 пкс. (увеличение 40х).
Интересно, что модель GL уже убрана с сайта Aperio - видимо, выпуск прекращен и теперь всем клиентам рекомендуется как минимум CS. Однако Biovitrum обещает осуществить продажу и GL, и даже его упрощенного собрата - GL-E.


Scanscope CS
Пятистекольная загрузка. Рассчитывается на нагрузку в 200-300 стекол в день. Стекло на объективе 20х сканируется медленнее, чем на GL - за 3 минуты. Но емкость кассеты подачи существенно сэкономит время, которое теряется на ручной замене препарата. Рабочее увеличение и разрешение снимка аналогично модели GL.


Scanscope XT
Загрузка 120 стекол одновременно. Из-за этого существенно растут габариты прибора по сравнению с младшими братьями - практически XT представляет собой куб со стороной в полметра. Рабочий объектив остается неизменным - 20х, поэтому и значение разрешающей способности не меняется. Заявленное время сканирования стекла - около 2 минут. Значит следует ожидать, что весь лоток со 120 препаратами сканер осилит примерно за 4 часа.

И пара моделей, информацию о которых Biovitrum у себя на сайте ещё не размещал:


Scanscope AT
Загрузчик на 400 стекол. Объектив прежний - 20х. На загрузку стекла уходит 20 секунд, на само сканирование - 95. Таким образом, за час гигант AT осилит около 30 препаратов, если вы его загрузите под завязку - работы хватит на весь день. При этом ему удается сохранить весьма компактные размеры - он даже меньше XT, который “съедает” в 3 раза меньшее количество препаратов.


Scanscope FL
Флюоресцентная модель от Aperio, также пока не продающаяся в России. Построена на базе CS - та же 5-стекольная загрузка и тот же объектив 20х. Сканирование проходит по 3 каналам и занимает до 15 минут при получении снимка квадрата 15х15 мм на обычных препаратах. Поддерживаемые размеры стекол - 25х75 мм, 50х75 мм. Максимальное разрешение - 0.23 мкм на 1 пкс. (результирующее увеличение - 40х). Смена фильтров автоматизированна, револьвер фильтров поддерживает до 6 длин волн.

Программное обеспечение для слайд-сканеров Aperio - предмет отдельного рассказа, но сразу хотелось бы упомянуть о некоторых специализированных сервисах (в том числе и не для владельцев сканеров), пока во многом используемых только на западном рынке, но и российским пользователям следовало бы обратить на них внимание:

Slide Scanning Service - присланное почтой стекло сканируется и цифровая копия высылается обратно на DVD, на 30-дневный пробный период цифровые препараты размещаются на специализированном веб-сайте от компании Spectrum
Digital Slide Hosting Service - специализированное хранилище цифровых копий препаратов, услуга предоставляется компанией Spectrum
SecondSlide Digital Slide Sharing Service - специализированное онлайн-хранилище цифровых копий, направленное на совместную работу по микропрепарату, предоставляет вьювер с несколькими простыми инструментами для расшаренных стекол (см. пример) Читать полностью...

понедельник, 5 декабря 2011 г.

Agfa HealthCare - новый игрок на рынке цифровой патологии



29 ноября 2011 на крупнейшем радиологическом конгрессе в США RSNA-2011 (97 Научная ассамблея и ежегодная встреча радиологического конгресса Северной Америки) в Чикаго Agfa Healthcare представила модуль цифровой патологии для своей системы IMPAX PACS (Комплекс для архивирования изображений и система связи), изначально предназначеной для хранения радиологических изображений. Решение представляет собой комплекс из высокопроизводительного сканера микропрепаратов целиком и аналитической рабочей станции, направленной на поиск взаимосвязей и обмен данными в радиологических и цифропатологических изображениях. Кроме того, в систему включены специализированные патологические приложения. Подобное решение, связующее столь разнотипные методы диганостики, Agfa удалось продемонстрировать первыми.


Логотип проводимого в Чикаго 97-го сообщества радиологов RSNA-2011


После проведения сканирования врач выбыирает зоны интереса (ROI) на полученном изображении, которые затем будут автоматически интегрированы в IMAX PACS. Agfa подчеркивает преимущества мультидиагностического решения и повышает командную междисциплинарную работу в онкологии, учебном процессе, расширенных исследованиях и более точных экспертных оценках. Интеграция позволяет оптимизировать рабочие процессы и облегчает сотрудничество между клиницистами, рентгенологами и патологами, что приводит к улучшению диагностических связей и более рациональному рабочему процессу.


IMPAX PACS от Agfa использует технологии компании XERO для получения радиологических изображений


Подробностей о технической организации самого модуля крайне немного: помимо пресс-релиза на официальных каналах Agfa отсутствует какая-либо информация. Как абсолютно правильно иронизирует автор блога TissuePathology, место для представления патологического модуля было выбрано очень интересно - все сообщество радиологов с большим успехом проигнорировало новый модуль, который предназначен совсем для других направлений диагностики. Но судя по всему, Agfa не стала выпускать собственное устройство для сканирования микропрепаратов, а лишь предложила систему хранения полученных изображений с уже существующего сканера. Какого из производителей Agfa будет рекомендовать как основного для своих комплексов - пока неизвестно. Но уже сейчас понятно, что и другие лидеры в производстве систем PACS, предназначенных для визуализации в радиологии - GE и Philips в ближайшее время подключат цифропатологические модули. Возможно, что это в принципе поспособствует распространению систем изучения морфологии и количественной статистики микроскопических изображений в лаборатории. К тому же, это может поспособствовать сплочению усилий специалистов лаборатории и радиологов в проведении диагностики пациента.


В рекламном ролике-презентации Agfa Healthcare на RSNA, как мы видим, показаны не только радиологические изображения. Но микроскопию они пока еще так и не показали широкой публике.


Филипп Гренье, руководитель отделения радиологии в университетском госпитале Ла Питье Сальпетье (La Pitie-Salpetriere) в Париже: "Объединение радиологии и сикроскопических изображений - это важнейший шаг на пути к интегрированной диагностике, в которой междисциплинарное взаимодействие и субспециализация используются максимально широко, что характерно например для госпиталей, имеющих свои учебные кафедры". Об улучшениях в диагностических процессах, которые несомненно скажутся на эффективности и качестве ухода за пациентом. Фредерик Капрен, руководитель отделения патологии Ла Питье Сальпетье: "Цифровая патология предлагает большее количество лучших инструментов. Интегрируя наши цифровые изображения в PACS систему, мы будем выходить на новый уровень клинического управления рабочим процессом ухода за пациентом."


Вход в госпиталь La Pitie Salpetriere


На данный момент, система проходит клинические испытания и в 2012 году ожидается ее поступление в продажу. Клинические испытания проводятся в Ла Питье Сальпетье на 1600 коек. Система не предназначена для поставок в учреждения здравоохранения в Канаде и США. В России система Agfa IMPAX PACS внедрена в НИИ детской неотложной хирургии и травматологии. О подключении цифропатологического модуля к московской системе пока не сообщалось. Читать полностью...